ПЛАЗМІДНІ ПРОФІЛІ ШТАМІВ БАКТЕРІЙ‑АНТАГОНІСТІВ РОДУ BACILLUS

Автор(и)

  • Ж. Ю. Сергєєва Одеський національний університет імені І.І. Мечникова, Ukraine
  • В. О. Іваниця Одеський національний університет імені І.І. Мечникова, Ukraine https://orcid.org/0000-0001-5325-3800

DOI:

https://doi.org/10.18524/2307-4663.2015.1(29).48019

Ключові слова:

Bacillus thuringiensis, Bacillus subtilis, плазміди, плазмідні профілі

Анотація

Метою дослідження було вивчення плазмідних профілів та ефективності виділення плазмід грампозитивних бактерій-антагоністів роду Bacillus різними методами. Методи. В роботі використано штами бактерій видів B. thuringiensis і B. subtilis. Виділення плазмідних ДНК з клітин бактерій здійснювали лужним методом Кадо і Ліу, методом Дженсена та методом Кроса. Плазмідну ДНК аналізували за допомогою електрофорезу в агарозному гелі. Результати. В результаті вивчення плазмідного складу штамів B. thuringiensis і B. subtilis було виявлено, що 90% штамів утримують від 5 до 7 позахромосомних елементів різного розміру. Висновок. Виявлені у досліджених штамів бацил плазміди умовно можна поділити на дві групи: невеликі плазміди, розміром приблизно 10 т.п.н., і мегаплазміди, розміром від 100 до 200 т.п.н. Для отримання повноцінної картини плазмідних профілів B. thuringiensis або B. subtilis найбільш ефективним є адаптований метод Дженсена.

Посилання

Andrup L. Detection of large plasmids from the Bacillus cereus group / L. Andrup, K. K. Barfod, G. B. Jensen, L. Smidt // Plasmid. – 2008. – V. 59, № 2. – P. 139–143.

Guglielmetti S. Small rolling circle plasmids in Bacillus subtilis and related species: organization, distribution, and their possible role in host physiology / S. Guglielmetti, D. Mora, C. Parini // Plasmid. –2007. – V. 57, № 3. – P. 245–264.

Jensen G.B. The genetic basis of aggregation system in Bacillus thuringiensis subsp. israelensis is located on the large conjugative plasmid pXO16 / G. B.Jensen et al. // J. Bacteriol. – 1995. – V. 177. – Р. 2914–2917.

Leplae R.I. A first global analysis of plasmid encoded proteins in the ACLAME database / R.I. Leplae, G. Lima-Mendez, A. Toussaint // FEMS Microbiol. Rev. – 2006. – V. 30, № 6. – P. 980–994.

Rohde C. Plasmid isolation from bacteria: some fast procedures / C. Rohde // World Journal of Microbiology and Biotechnology. – 1995. – V. 11, Issue 3. – P. 367–369.

Zhong C. Determination of plasmid copy number reveals the total plasmid DNA amount is greater than the chromosomal DNA amount in Bacillus thuringiensis YBT-1520/ C. Zhong et al. // PLoS ONE. – 2011. – V. 6, № 1. – Р. 1–8.

##submission.downloads##

Опубліковано

2015-03-15

Номер

Розділ

ЕКСПЕРИМЕНТАЛЬНІ ПРАЦІ