DOI: https://doi.org/10.18524/2307-4663.2009.3(7).103034

ВІДМІННОСТІ ЛОКАЛЬНИХ ПОПУЛЯЦІЙ RHIZOBIUM LEGUMINOSARUM BV. TRIFOLII: З'ВЯЗОК МІЖ ГЕНЕТИЧИМИ І ФІЗІОЛОГІЧНИМИ ОЗНАКАМИ

Е. Вільбо, M. Марек-Козачук, A. Мазур, A. Кубік-Комар, A. Скорупська

Анотація


Досліджена генетична та метаболічна варіабільність Rhizobium leguminosarum bv. trifolii у контексті можливих зв’язків між метаболо-фізіологічними ознаками ризобій. Були встановлені значні генетичні відмінності у 16-23S рДНК регіонах та в плазмідних профілях досліджуваних штамів. Штами, розподілені на групи за допомогою PCR-RFLP, значно відрізнялися. Метаболічний профіль ризобій, досліджений з використанням Biolog тесту, показав суттєві відмінності навіть у межах однієї генетичної групи. РСА аналіз метаболічних властивостей виявив відмінності в утилізації двох великих груп субстратів: (а) цукрів і (б) органічних кислот, амінокислот та модифікованих цукрів, які у роботі названі «не-цукри». Утилізація хімічно різних цукрів ризобіями спостерігалася частіше, ніж «не-цукрів». Утилізація «цукрів» і «не-цукрів» позитивно корелювала з генетичними відмінностями штамів, що належали до PCR-RFLP груп 1, 2 і 3. Штами 4-ї групи по різному утилізували «цукри» і «не-цукри». Були виявлені значні відмінності у здатності цих PCR-RFLP груп штамів рости на різних середовищах. Зроблено висновок, що локальні популяції Rhizobium leguminosarum bv. trifolii не є однорідними. Вони складаються з фізіологічно відмінних штамів, різна метаболічна активність яких є відображенням їх генетичної неоднорідності.

Ключові слова


Rhizobium leguminosarum; метаболічні і генетичні відмінності

Повний текст:

PDF (English)

Пристатейна бібліографія ГОСТ


Brom S., García-de los Santos A., Cervantes L., Palacios R., Romero D. In Rhizobium etli symbiotic plasmid transfer, nodulation competitivity and cellular growth require interaction among different replicons // Plasmid. - 2000. - 44. - P. 34-43.

Depret G., Laguerre. G. Plant phenology and genetic variability in root and nodule development strongly influence genetic structuring of Rhizobium leguminosarum biovar viciae populations nodulating pea // New Phytol. - 2008. -179. - P. 224-235.

Eckhardt T. A rapid method for the identification of plasmid deoxyribonucleic acid in bacteria // Plasmid. - 1978. - 1. - P. 584-588.

Laguerre G., Mavingui P., Allard M. R., Charnay M. P., Louvrier P., Mazurier S. I., Rigottier-Gois L., Amarger N. Typing of rhizobia by PCR DNA fingerprinting and PCR-restriction fragment length polymorphism analysis of chromosomal and symbiotic gene regions: application to Rhizobium leguminosarum and its different biovars // Appl. Environ. Microbiol. - 1996. - 62. - P. 2029-2036.

Laguerre G., Louvrier P., Allard M.R., Amarger N. Compatibility of rhizobial genotypes within natural populations of Rhizobium leguminosarum biovar viciae for nodulation of host legumes // Appl. Environ. Microbiol. - 2003. - 69. - P. 2276-2283.

Morrison D.F. Multivariate statistical methods. McGraw-Hill 3rd ed., New York, NY, USA, 1990.

Mutch L.A., Young J.P. Diversity and specificity of Rhizobium leguminosarum biovar viciae on wild and cultivated legumes // Mol. Ecol. - 2004. - 13. - P. 2435-2444.

Oresnik I.J., Pacarynuk L.A.,. O`Brien S.H.P, Yost C., Hynes M.F. Plasmid-encoded catabolic genes in Rhizobium leguminosarum bv. trifolii: evidence for a plant-inducible rhamnose locus involved in competition for nodulation // Mol. Plant Microbe Interact. - 1998. - 11. - P. 1175-1185.

Oresnik I.J., Liu S.L., Yost C.K., Hynes M. F. Megaplasmid pRme2011a of Sinorhizobium meliloti is not required for viability // J. Bacteriol. - 2000. - 182. - P. 3582-3586.

Palacios R., Newton W.E. Genomes and genomics of nitrogen-fixing organisms. Rafael Palacios and William E. Newton ed. - Dordrecht: Springer, 2005.

Perret X., Staehelin C., Broughton W.J. Molecular basis of symbiotic promiscuity // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 2000. - 64. - P. 180-201.

Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press 2nd ed., Cold Spring Harbor, NY, USA, 1989.

Vincent J.M. A manual for the practical study of root nodule bacteria. International biological program handbook no.15. Oxford: Blackwell Scientific Publications Ltd., 1970.

Wielbo J., Marek-Kozaczuk M., Kubik-Komar A., Skorupska A. Increased metabolic potential of Rhizobium spp. is associated with bacterial competitiveness // Can. J. Microbiol. - 2007. - 53. - P. 957-967.

Young J.P., Crossman L.C., Johnston A.W.,. Thomson N.R, Ghazoui Z.F., Hull K.H., Wexler M., Curson A.R., Todd J.D., Poole P.S., Mauchline T.H., East A.K., Quail M.A., Churcher C., Arrowsmith C., Cherevach I., Chillingworth T., Clarke K., Cronin A., Davis P., Fraser A., Hance Z., Hauser H., Jagels K., Moule S., Mungall K., Norbertczak H., Rabbinowitsch E., Sanders M., Simmonds M., Whitehead S., Parkhill J. The genome of Rhizobium leguminosarum has recognizable core and accessory components // Genome Biol. - 2006. - 7. - P. 34.





Creative Commons License
Ця робота ліцензована Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

ISSN 2076-0558 (Print); 2307-4663 (Online)

DOI 10.18524/2307-4663