АНАЛІЗ НОВИХ ПОЛІФТОРТІОАЦИЛЬОВАНИХ ПОХІДНИХ АМІНОКИСЛОТ МЕТОДАМИ IN SILICO ТА IN VITRO
DOI:
https://doi.org/10.18524/2307-4663.2017.4(40).118939Ключові слова:
вірус Епштейна-Барра, ефіри тетрафторопропантіоацильованих амінокислот, in silico, in vitroАнотація
Мета роботи – проаналізувати потенційну біологічну активність та мішень дії похідних ефірів поліфтороалкантіоацильованих амінокислот за допомогою методів in silico, а також вивчити прогнозовані властивості in vitro. Матеріали та методи. Були використані: програмне забезпечення PASS, веб-сервер PharmMapper, ПЛР, МТТ-аналіз, забарвлення трипановим синім та метод нейтрального червоного. Результати. Згідно з прогнозом PASS, дві сполуки (10S20 та 10S21) можуть мати противірусну активність, Pa/Pi становить 0,294/0,005 та 0,214/0,084, відповідно. Крім того, всі сполуки можуть бути субстратами цитохрому c, який відіграє важливу роль в індукції апоптозу. Кілька мішеней були визначені за допомогою молекулярного стикування (PharmMapper). Було показано, що більшість прогнозованих мішеней є білками, зокрема, вірусний білок Gag-Pol та різні види протеїнкіназ. Дослідження in vitro показало, що всі сполуки інгібують реплікацію вірусу Епштейна-Барр. З іншого боку, похідні ефірів поліфтороалкантіоацильованих амінокислот мали високий рівень цитотоксичності на різних лініях лимфобластоїдних клітин, що може бути зумовлено механізмом дії сполук. Висновки. Дослідження in silico є перспективним підходом до розробки нових антивірусних препаратів. Наші результати дозволяють віднести сполуку трет-бутил (2,2,3,3-тетрафторопропантіоїл)аланінат до перспективних анти-ВЕБ агентів. Отримані дані показали, що похідні ефірів поліфтороалкантіоацильованих амінокислот (10S21 та 10S22) можуть мати апоптоз-модулюючий вплив, що є ключовим аспектом при розробці препаратів для онкологіних захворювань, індукованих вірусними інфекціями.
Посилання
Lapach S.N., Chubenco A.V., Babich P.N. Statistical methods in medical and biological research using Excel.- Кyiv: МОRIОN. – 2001. 408 [In Russian].
Balasundaram A., Ragupathy R., Sankar S., Thiyagarajan M., Ravi L., Karuppasamy R., Veerappapillai S. Investigation of Phytocompounds and Computational Approach for the Evaluation of Therapeutic Properties of Ethanolic Leaf Extract ofCallistemon citrinus. Int. J. Pharm. Sci. Rev. Res. 2016; 37(1):110-116.
Borenfreund E. Puerner J. Toxicity determined in vitro by morphological alterations and neutral red absorption. Toxicol Lett. 1985; 24(2–3):119–124.
Filimonov D, Lagunin A, Gloriozova T, Rudik A, Druzhilovskii D, Pogodin P, Poroikov V. Prediction of the biological activity spectra of organic compounds using the PASS online web resource. Chemistry of Heterocyclic Compounds. 2014; 50(3):444-457.
Li N, Thompson S, Jiang H, Lieberman P, Luo C. Development of the drug for Epstein-Barr virus using high-throughput in silico virtual screening. Expert Opin Drug Discov. 2010; 5(12):1189-1203.
Lin J. Antiviral therapy for Epstein-Barr virus-associated diseases. Chi Med J. 2005; 17(1):1-10.
Mosmann T. Rapid colorimetric assay for cellular growth and survival: application to proliferation and cytotoxicity assays. J Immunol Methods. 1983; 65:55-63.
Pikun N, Mykhaylychenko S, Kulik I, Shermolovich Yu. Primary polyfluoroalkanethioamides as mild thioacylating reagents for alkyl amines and α-amino acid esters. J. Fluorine Chem. 2016; 185 :86−90.
Romain C, Balfour H, Vezina H, Holman C. A method for evaluating antiviral drug susceptibility of Epstein-Barr virus. Virus Adaptation and Treatment. 2010; 2:1-7.
Strober W. Trypan Blue Exclusion Test of Cell Viability. Current Protocols in Immunology. 2001; 21:A.3B.1-A.3B.2.
Swinson J. Fluorine – a vital element in the medicine chest. PharmaChem. 2005; 25(1):26–30.
Tonder A, Joubert A, Cromarty D. Limitations of the 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl-2H-tetrazolium bromide (MTT) assay when compared to three commonly used cell enumeration assays. BMC Research Notes. 2015; 8(47):1-10.
Wang X, Shen Y, Wang S, Li S, Zhang W, Liu X, Lai L, Pei J, Li H. PharmMapper 2017 update: a web server for potential drug target identification with a comprehensive target pharmacophore database. Nucleic Acids Res. 2017; 45(W1):356-360.
Young L, Yap L. Murray P. Epstein-Barr virus: more than 50 years old and still providing surprises. Nature Reviews Cancer. 2016; 16:789-802.
##submission.downloads##
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2017 Мікробіологія і біотехнологія
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
Автор передає журналу (університету) на безоплатній основі невиключні права на використання статті (на весь строк дії авторського права починаючи з моменту публікації, розміщення статті на веб-сторінці журналу, в репозитарії відкритого доступу) без одержання прибутку; на відтворення статті чи її частин в електронній формі (включаючи цифрову); виготовлення ії електронних копій для постійного архівного зберігання; виготовлення електронних копій статті для некомерційного розповсюдження; внесення статті до бази даних репозитарію; надання електронних копій статті в доступі мережі інтернет.
Автор гарантує, що у статті не використовувалися статті або авторські права, які належать третім особам; гарантує, що на момент розміщення статті на веб-сторінці, в репозитарії ОНУ лише йому належать виключні майнові права на статтю, що розміщується; майнові права на статтю ні повністю, ні в частині нікому не передано (не відчуджено), майнові права на статтю ні повністю, ні в частині не є предметом застави, судового спору або претензій з боку третіх осіб.
Автор зберігає за собою право використовувати самостійно чи передавати права на використання статті третім особам.
Автор надає журналу право на використання статті такими способами:
переробляти, адаптувати або іншим чином змінювати її за погодженням з автором; перекладати статтю у випадку, коли стаття викладена мовою іншою, ніж мова, якою передбачена публікація у виданні. Якщо журнал виявить бажання використовувати статтю іншими способами: перекладати, розміщувати повністю або частково у мережі інтернет, публікувати статтю в інших, в тому числі іноземних виданнях, включати статтю як складову частину до інших збірників, антологій, енциклопедій тощо, умови оформлюються додатковою угодою.
Автор підтверджує, що він є автором (співавтором) цієї статті; авторські права на дану статтю не передані іншому видавцю; дана стаття не була раніше опублікована у будь-якому іншому виданні до публікації її журналом.
Публікація праць в Журналі здійснюється на некомерційній основі. Комісійна плата за оформлення статті не стягується.
