ЧИСЕЛЬНІСТЬ І БІОЛОГІЧНІ ВЛАСТИВОСТІ БАКТЕРІЙ PANTOEA AGGLOMERANS, ВИДІЛЕНИХ З РІЗНИХ СОРТІВ ВИНОГРАДУ ОДЕСЬКОЇ ОБЛАСТІ
DOI:
https://doi.org/10.18524/2307-4663.2018.3(43).142585Ключові слова:
Pantoea agglomerans, ендофітне середовище виноградної лози і пухлин, чисельність, біологічні властивостіАнотація
Мета. Ізолювати і дослідити біологічні властивості Pantoea agglomerans із внутрішнього середовища виноградної лози і пухлин виноградної лози, відібраних з виноградників Одеської області. Методи. Зразки виноградної лози сортів «Аркадія», «Молдова» і «Одеський сувенір» і пухлин, зрізаних з ураженої лози цих сортів, попередньо стерилізували фламбуванням, подрібнювали на фрагменти, вносили їх у колби з дистильованою водою і перемішували в шейк ері при 28 °С протягом 3 год. Робили серію 10-ти кратних послідовних розведень і висівали на поверхню чашок Петрі з поживним агаром. Інкубували при 28 °С протягом 24–48 год. Проводили кількісний облік, виділяли чисті культури і досліджували їх культуральні, морфологічні, фізіолого-біохімічні властивості, визначали склад клітинних ліпідів та проводили ідентифікацію виділених штамів. Антагоністичну активність P. agglomerans визначали лунково-дифузійним методом. Результати. Чисельність бактерій у внутрішньому середовищі винограду коливалася у межах 5,63 ± 1,3×103 КУО/см3 – 2,96 ± 1,3×105 КУО/см3 і залежала від пори року і сорту винограду. Кількість мікроорганізмів у пухлинах була більшою ніж в неушкодженій лозі у той же період. Масова частка P. agglomerans у лозі коливалася від 5,7% до 68,2%, у пухлинах – від 9,88% до 23,08%. Штами P. agglomerans, виділені із ендофітного середовища винограду і пухлин, характеризувалися однаковими морфологічними, культуральними, тінкторіальними, фізіологічними властивостями. Незначні відмінності спостерігалися у здатності до утилізації вуглеводів. Штами Pantoea із пухлин не споживали цукрозу і 25,0 % утилізували раффінозу в аеробних умовах, на відміну від штамів із неушкодженої лози. Жирнокислотний спектр був представлений жирними кислотами, що містять у ланцюзі від 12 до 19 атомів вуглецю. За жирнокислотним складом вісімнадцать штамів були ідентифіковані як P. agglomerans-GC subgroup A. Для досліджуваних штамів домінантними в профілі є С16:0, С12:0, С14:0, С17:0 cyclow7c. Виділені штами P. agglomerans не проявили антагоністичної активності щодо колекційних штамів E. carotovora, A. tumefaciens i A. vitis. Висновки. Кількісний склад мікробіоти ендофітного середовища лози і пухлин був неоднаковим і залежав від джерела виділення, погодних умов і сорту винограду. Штами P. agglomerans, виділені із лози і пухлин, характеризувалися однаковими біологічними ознаками, за виключенням здатності до утилізації окремих вуглеводів. Жирнокислотний склад досліджених штамів Pantoea був представлений жирними кислотами з 12–19 атомів вуглецю у ланцюзі. Антагоністичної активності до колекційних штамів E. carotovora, A. tumefaciens i A. vitis не виявлено.Посилання
Ivanytsia VO, Gorshkova OG, Korotaieva NV, Voluvach OV, Gudzenko TV, Ostapchuk AM. The composition of fatty acids of strain Bacillus sp. ОZ-5, isolated from oil contaminated groud from Zmiiniy island. // Mikrobiologiia I biotechnologiia. 2015; 32(4): 28–36. (in Ukrainian)
Netrusov AI, Egorova MA, Zaharchuk LM, Kolotilova NN Microbiology of work shop: Textbook for higher education institutions. // Moscow: Akademiya, 2005. 608.(in Russian)
Andrews JH, Harris RF. The ecology and biogeography of microorganisms on plant surfaces. Ann. Rev. Phytopathol. 2000; 38:145–180.
Brady C L. Emended description of the genus Pantoea, description of four species from human clinical samples, Pantoeaseptica sp. nov., Pantoeaeucrina sp. nov., Pantoeabrenneri sp. Nov. and Pantoeaconspicua sp. nov., and transfer of Pectobacteriumcypripedii (Hori 1911) Brenner et al. 1973 emend. Hauben et al. 1998 to the genus as Pantoeacypripedii comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2010; 60: 2430–2440.
Brady CL, Cleenwerck I, Westhuizen, LV, Venter, SN, Coutinho TA, Vos P D. Pantoea rodasii sp. nov., Pantoea rwandensis sp. nov. and Pantoea wallisii sp. nov., isolated from Eucalyptus. International Journal Of Systematic And Evolutionary Microbiology. 2016; 62:1457–1464.
Brady CL. Phylogeny and identification of Pantoea species associated with plants, humans and the natural environment based on multilocus sequence analysis (MLSA). Syst. Appl. Microbiol.2008; 31: 447–460.
Costa E, Teixidó N, Usall J, Atarés E, Viñas I. Production of the biocontrol agent Pantoea agglomerans strain CPA -2 using commercial products and byproducts. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001; 56: 367–371.
Cruz AT, Cazacu AC, Allen CH. Pantoea agglomerans: a plant pathogen causing human disease. J. Clin. Microbiol. 2007;45(6): 1989–1992.
Dutkiewicz J, Mackiewicz B, Kinga Lemieszek M, Golec M, Milanowski J. Pantoea agglomerans: a mysterious bacterium of evil and good: Part III. Deleterious effects: infections of humans, animals and plants. Ann. Agric. Environ. Med. 2016; 23 (2): 197–205.
Dutkiewicz J, Mackiewicz B, Kinga Lemieszek M, Golec M, Milanowski J. Pantoea agglomerans: a mysterious bacterium of evil and good: Part IV. Beneficial effects. Ann. Agric. Environ. Med. 2016; 23 (2): 206–222.
Dutkiewicz J, Mackiewicz B, Kinga Lemiesze, M, Golec, M Milanowski J. Pantoea gglomerans: a mysterious bacterium of evil and good. Part III. Deleterious effects: infections of humans, animals and plants. Ann. Agric. Environ. Med. 2016; 23: 197–205 .
Gavini F, Mergaert J, Beji A, Mielcarek C, Izard D, Kersters K, De Ley J. Transfer of Enterobacter agglomerans (Beijerinck 1888)Ewing and Fife 1972 to Pantoea gen. nov. as Pantoea agglomerans comb. nov. and description of Pantoea dispersa sp. nov. Int. J. Syst. Bacteriol.1989; 39 (3): 337–345.
Kato Tanaka, Y. Pantoea theicola sp. nov., isolated from black tea. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2015; 65: 3313–3319.
Lim, JA, Lee DH, Kim BY, Heu S. Draft genome sequence of Pantoea agglomerans R190, a producer of antibiotics against phytopathogens and foodborne pathogens. J. Biotechnol.2014; 188: 7–8.
Mishra A, Chauhan PS, Chaudhry V, Tripathi M, Nautiyal CS Rhizosphere competent Pantoea agglomerans enhances maize (Zea mays) and chickpea (Cicer arietinum L.) growth, without altering the rhizosphere functional diversity. Anton. Leeuw. Int. J. G. 2011; 100: 405–413.
Mergaert J, UGent LV, Kersters K. Transfer of Erwinia-ananas (synonym, Erwinia-uredovora) and Erwinia-stewartii to the genus Pantoea emend as Pantoeaananas (serrano 1928) comb-nov and Pantoea-stewartii (smıth 1898) comb-nov, respectively, and description of Pantoea-stewartii subsp indologenes subsp nov. Int. J. Syst. Bacteriol. 1993; 43: 162–173.
Popp A, Cleenwerck I, Iversen C, De Vos P, Stephan R. Pantoea gaviniae sp. nov. and Pantoea calida sp. nov., isolated from infant formula and an infant formula production environment. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2010; 60: 2786– 2792.
Rezzonico F, Smits THM, Montesinos E, Frey JE, Duffy B. Genotypic comparison of Pantoea agglomerans plant and clinical strains. BMC Microbiology. 2009; 9: 204.
Sturz AV, Christie BR, Nowak J. Bacterial endophytes: potential role in developing sustainable systems of crop production. Critical Reviews in Plant Science. 2000; 19: 1–30.
##submission.downloads##
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2018 Мікробіологія і біотехнологія
![Creative Commons License](http://i.creativecommons.org/l/by-nc/4.0/88x31.png)
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
Автор передає журналу (університету) на безоплатній основі невиключні права на використання статті (на весь строк дії авторського права починаючи з моменту публікації, розміщення статті на веб-сторінці журналу, в репозитарії відкритого доступу) без одержання прибутку; на відтворення статті чи її частин в електронній формі (включаючи цифрову); виготовлення ії електронних копій для постійного архівного зберігання; виготовлення електронних копій статті для некомерційного розповсюдження; внесення статті до бази даних репозитарію; надання електронних копій статті в доступі мережі інтернет.
Автор гарантує, що у статті не використовувалися статті або авторські права, які належать третім особам; гарантує, що на момент розміщення статті на веб-сторінці, в репозитарії ОНУ лише йому належать виключні майнові права на статтю, що розміщується; майнові права на статтю ні повністю, ні в частині нікому не передано (не відчуджено), майнові права на статтю ні повністю, ні в частині не є предметом застави, судового спору або претензій з боку третіх осіб.
Автор зберігає за собою право використовувати самостійно чи передавати права на використання статті третім особам.
Автор надає журналу право на використання статті такими способами:
переробляти, адаптувати або іншим чином змінювати її за погодженням з автором; перекладати статтю у випадку, коли стаття викладена мовою іншою, ніж мова, якою передбачена публікація у виданні. Якщо журнал виявить бажання використовувати статтю іншими способами: перекладати, розміщувати повністю або частково у мережі інтернет, публікувати статтю в інших, в тому числі іноземних виданнях, включати статтю як складову частину до інших збірників, антологій, енциклопедій тощо, умови оформлюються додатковою угодою.
Автор підтверджує, що він є автором (співавтором) цієї статті; авторські права на дану статтю не передані іншому видавцю; дана стаття не була раніше опублікована у будь-якому іншому виданні до публікації її журналом.
Публікація праць в Журналі здійснюється на некомерційній основі. Комісійна плата за оформлення статті не стягується.