ВПЛИВ ДЕКСТРАНУ 70 НА АГРЕГАЦІЮ ПРОТИПУХЛИННОГО ЦИТОКІНА ЕМАР ІІ
DOI:
https://doi.org/10.18524/2307-4663.2019.3(47).182815Ключові слова:
цитокін ЕМАР ІІ, декстран 70, агрегація, молекулярний докінг, E. coli BL21(DE3)pLysEАнотація
Мета. Визначення впливу температури на агрегаційні властивості рекомбінантного цитокіна ЕМАР ІІ (ендотеліальний моноцит, що активує поліпептид ІІ) та його комплексу з поліцукридом декстраном 70 в розчині. Методи. Бактеріальна експресія рекомбінантного білка, метал-хелатувальна афінна хроматографія, динамічне розсіювання світла, моделювання просторової структури. Результати. Досліджені агрегаційні властивості рекомбінантного цитокіна ЕМАР ІІ та його комплексу з декстраном 70 і встановлені розміри комплекса методом динамічного розсіювання світла. Показана стабілізація цитокіна ЕМАР ІІ декстраном 70 при підвищенні температури в межах від 20 °С до 55 °С. За допомогою комп’ютерного моделювання молекулярного докінгу запропоновані можливі механізми агрегації цитокіну ЕМАР ІІ та його стабілізації декстраном 70. Висновки. Отримані результати свідчать, що протипухлинний рекомбінантний цитокін ЕМАР ІІ утворює білкові агрегати при підвищенні температури. Стабільність цитокіна ЕМАР ІІ в розчині підвищується в результаті взаємодії з декстраном 70. Стабілізація структури ЕМАР ІІ в комплексі розширює можливості досліджень протипухлинних властивостей цього цитокіна та його практичного використання.Посилання
Pérez-Herrero E, Fernández-Medarde A. Advanced targeted therapies in cancer: Drug nanocarriers, the future of chemotherapy. Eur. J. Pharm. Biopharm. 2015; (93):52 – 79.
Pesarrodona M, Jauset T, Díaz-Riascos ZV. et al. Antitumoral proteins to breast cancer by local administration of functional inclusion bodies. Adv. Sci. 2019;(18). doi: 10.1002/advs.201900849.
Chaudhuri R, Cheng Y, Middaugh CR, Volkin DB. High-Throughput Biophysical Analysis of Protein Therapeutics to Examine Interrelationships Between Aggregate Formation and Conformational Stability. AAPS J. 2013; (1): 48 – 64.
Bond MD, Panek ME, Zhang Z, Wang D, Mehndiratta P, Zhao H, Volkin DB. Evaluation of a Dual-Wavelength Size Exclusion HPLC Method With Improved Sensitivity to Detect Protein Aggregates and Its Use to Better Characterize Degradation Pathways of an IgG1 Monoclonal Antibody. J. Pharm. Sci. 2010; 99(6):2582 – 2597.
Wuchner K, Büchler J, Spycher R, Dalmonte P, Volkin DB. Development of a Microflow Digital Imaging Assay to Characterize Protein Particulates During Storage of a High Concentration IgG1 Monoclonal Antibody Formulation. J. Pharm. Sci. 2010; 99(8): 3343 – 3361.
Wu F, Zhou Z, Su J, Wei L, Yuan W, Jin T. Development of dextran nanoparticles for stabilizing delicate proteins. Nanoscale Res. Let. 2013; 8(1): 197. doi: 10.1186/1556-276X-8-197.
Reznikov A, Chaykovskaya L, Polyakova L, Kornelyuk A. Antitumor effect of endothelial monocyte-activating polypeptide-II on human prostate adenocarcinoma in mouse xenograft model. Exp. Oncol. 2007; (29): 267 – 71.
Lal CV, Schwarz MA. Vascular Mediators in Chronic Lung Disease of Infancy: Role of Endothelial Monocyte Activating Polypeptide II (EMAP II). Birth Defects Res. 2014; 100(1): 180 – 188.
Kolomiets-Babenko LA, Bohorad-Kobelska OS, Kovalchuk NL, Spivak MJa, Kornelyuk AI. Nanocomposite Complex EMAP II Influence on Tumor Necrosis Factor and Interferon. Biotech. Acta. 2016; 9(5): 18 – 23.
Berger AC, Alexander HR, Wu PC et al. Тumor necrosis factor receptor I (p53) is upregulated on endothelial cell by exposure to the tumor derived cytokine endothelial monocyte-activating polypeptide II (EMAP II). Cytokine. 2000; (12): 992 – 1000.
Kwon HS, Park MC, Kim DG, Cho K, Park YW, Han JM. Identification of CD23 as a functional receptor for the proinflammatory cytokine AIMP1/p43. Journal of Cell Science. 2012; 125(19): 4620 – 4629.
Sambrook J, Fritsch EF, and Maniatis T. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. New York: C.S.H.L. Press; 1989; 2nd ed.
Babenko LA, Skorobogatov OYu, Dubrovskyi OL, Kornelyuk AІ. Optimization bacterial expression of the antitumor cytokine EMAP II in E. coli BL21 (DE3) pLysE cells. Microb.Biotech. 2010; (3):21 – 31.
Lozhko DM, Zhukov IYu, Kornelyuk AІ. Bacterial expression and isotope labeling of 13C/15N cytokine EMAP II for structural studies by NMR spectroscopy. Biopol. Cell. 2011; 27(4):273 – 278.
Nanocomposite anticancer drug. Kornelyuk A.I., Babenko L.A., Kozlov A.V. – № 64374. Opubl.10.11.2011 Byul. N 21.
Comeau SR, Gatchell DW, Vajda S, Camacho CJ. ClusPro: an automated docking and discrimination method for the prediction of protein complexes. Bioinformatics. 2004; 20(1): 45 – 50.
Schneidman-Duhovny D, Inbar Y, Nussinov R, Wolf-son HJ. PatchDock and SymmDock: servers for rigid and symmetric docking. Nucl. Acids Res. 2005; 1(33) (Web Server Issue): W363 – W367.
Pettersen EF, Goddard TD, Huang CC, Couch GS, Greenblatt DM, Meng EC, Ferrin T.E. UCSF Chimera-A visualization system for exploratory research and analysis. J. Comput. Chem. 2004; 25(13): 1605 – 1612.
Trott O, Olson AJ. AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading. J. Comp. Chem. 2010; 31(2): 455 – 461.
##submission.downloads##
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2019 Мікробіологія і біотехнологія
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
Автор передає журналу (університету) на безоплатній основі невиключні права на використання статті (на весь строк дії авторського права починаючи з моменту публікації, розміщення статті на веб-сторінці журналу, в репозитарії відкритого доступу) без одержання прибутку; на відтворення статті чи її частин в електронній формі (включаючи цифрову); виготовлення ії електронних копій для постійного архівного зберігання; виготовлення електронних копій статті для некомерційного розповсюдження; внесення статті до бази даних репозитарію; надання електронних копій статті в доступі мережі інтернет.
Автор гарантує, що у статті не використовувалися статті або авторські права, які належать третім особам; гарантує, що на момент розміщення статті на веб-сторінці, в репозитарії ОНУ лише йому належать виключні майнові права на статтю, що розміщується; майнові права на статтю ні повністю, ні в частині нікому не передано (не відчуджено), майнові права на статтю ні повністю, ні в частині не є предметом застави, судового спору або претензій з боку третіх осіб.
Автор зберігає за собою право використовувати самостійно чи передавати права на використання статті третім особам.
Автор надає журналу право на використання статті такими способами:
переробляти, адаптувати або іншим чином змінювати її за погодженням з автором; перекладати статтю у випадку, коли стаття викладена мовою іншою, ніж мова, якою передбачена публікація у виданні. Якщо журнал виявить бажання використовувати статтю іншими способами: перекладати, розміщувати повністю або частково у мережі інтернет, публікувати статтю в інших, в тому числі іноземних виданнях, включати статтю як складову частину до інших збірників, антологій, енциклопедій тощо, умови оформлюються додатковою угодою.
Автор підтверджує, що він є автором (співавтором) цієї статті; авторські права на дану статтю не передані іншому видавцю; дана стаття не була раніше опублікована у будь-якому іншому виданні до публікації її журналом.
Публікація праць в Журналі здійснюється на некомерційній основі. Комісійна плата за оформлення статті не стягується.
