МОНІТОРИНГ ГЕНЕТИЧНОЇ РІЗНОМАНІТНОСТІ ПОПУЛЯЦІЇ PHYTOPHTHORA INFESTANS – ЗБУДНИКА ФІТОФТОРОЗУ КАРТОПЛІ НА ТЕРИТОРІЇ УКРАЇНИ

Автор(и)

  • Б. С. Жуков Випробувальний центр ІП «СЖС Україна», Україна
  • Є. В. Демедюк Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, Україна
  • Т. В. Гудзенко Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, Україна https://orcid.org/0000-0003-4463-450X

DOI:

https://doi.org/10.18524/2307-4663.2025.3(65).344540

Ключові слова:

фітофтороз картоплі, генотипи Phytophthora infestans, кластерний аналіз, Україна

Анотація

Знання генетичної структури популяцій таких фітопатогенів як Phytophthora infestans є невід’ємною частиною успішного контролю фітофторозу – широко розповсюдженої найбільш руйнівної хвороби картопляних культур, яка завдає величезних економічних збитків у всіх країнах світу. Мета. Встановити генетичну різноманітність популяції P. іnfestans – збудника фітофторозу картоплі на території України. Методи. Ізоляцію чистих культур P. infestans проведено методом блоттерів на картопляних дисках з наступним послідовним пересіванням на житній агар з додаванням ріфампіцину (RAB-R) та картопляно-декстрозний агар (PDA). Генетичне типування ліній вітчизняних P. infestans проводили за допомогою SSP ПЛР аналізу. Аналітичні дендрограми формували за допомогою програмного забезпечення MEGA 1. Результати. У результаті проведеного молекулярно-генетичного аналізу з використанням 10 мікросателітних маркерів, 35 вітчизняних ізолятів P. іnfestans розподілилися на 17 генотипів, що свідчить про високий рівень поліморфності у популяції, яка не пов’язана ні з регіоном виділення, ні з сортом ураженої картоплі. Частота генотипів коливалася від 2,86 до 11,43%. Найбільш розповсюдженими на Україні генотипами виявилися С, F та G. Найменшу генетичну різноманітність було виявлено у популяції P. infestans Львівської області. Зразки, що отримано з інших областей, демонструють високу гетерогенність. Кореляції між регіонами та сортами картоплі, з яких отримано зразки P. infestans, та їх генотипами не спостерігається. Висновки. Встановлено генетичну різноманітність популяції збудника фітофторозу картоплі на території України – 35 вітчизняних ізолятів P. іnfestans розподілилися на 17 генотипів без значного зміщення в бік певного варіанту, що свідчить про високий рівень поліморфності у популяції.

Посилання

Cooke DEL, Kessel GJT, Lassen P, Hansen JG The European population of Phytophthora infestans in a global context. Proceedings of the seventeenth EuroBlight workshop. WUR-special report. 2019;9:35–36. https://agro.au.dk/fileadmin/euroblight/Workshops/York/Presentations_and_posters/Proceedings/2._David_Cooke-p35-36.pdf

El-Ganainy SM, Iqbal Z, Awad HM, Sattar MN, Tohamy AM et al. Genotypic and phenotypic structure of the population of Phytophthora infestans in Egypt revealed the presence of European genotypes. J. Fungi. 2022;8(5):468. https://doi.org/10.3390/jof8050468

EuroBlight 12-plex SSR genotyping of Phytophthora infestans. Vers. 1.0 April 2020. 2020;25. https://agro.au.dk/fileadmin/euroblight/Protocols/12plex_genotyping_Protocol_Apr_2020.pdf

Fry WE Phytophthora infestans: the itinerant invader; “late blight” the persistent disease. Phytoparasitica. 2020;48:87–94. https://doi.org/10.1007/s12600-019-00778-3

Ghislain M, Byarugaba AA, Magembe E, Njoroge A et al. Stacking three late blight resistance genes from wild species directly into African highland potato varieties confers complete field resistance to local blight races. Plant Biotechnology Journal. 2019;17:1119–1129. https://doi.org/10.1111/pbi.13042

Holiachuk Y, Kosylovych H Spread of quarantine plant diseases and Phytonematodes in Ukraine. Quarantine and Plant Protection. 2025;1(280):20–28. https://doi.org/10.36495/2312-0614.2024.2.21-28

ISO 21571:2005 Foodstuffs – Methods of analysis for the detection of genetically modified organisms and derived products – Nucleic acid extraction [Valid from 2013-03]. Official edition International Standard Organisation. 2013;10. https://cdn.standards.iteh.ai/samples/56166/eff265102d8345bda8ad40161fa73886/ISO-21571-2005-Amd-1-2013.pdf

Janiszewska M, Sobkowiak S, Stefanczyk E, Sliwka J Population structure of Phytophthora infestans from a single location in Poland over a long period of time in context of weather conditions. Microb. Ecol. 2021;81:746–757. https://link.springer.com/article/10.1007/s00248-020-01630-6

Loukas I, Kanetis LI, Pittas L, Nikoloudakis N et al. Characterization of Phytophthora infestans populations in Cyprus, the southernmost potato-producing European country. Plant Disease. 2021;11:3407– 3417. https://doi.org/10.1094/PDIS-12-20-2694-RE

Lubis YF, Hasanuddin Y, Safni I The effectively test of the metalaxyl on different concentrations and application intervals to Phytopthora infestans that caused potato late blight in the wet season in the Karo highlands. IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. 2021;782(4). https://doi.org/10.1088/1755-1315/782/4/042021

Maurice S, Montes MS, Nielsen BJ et al. Population genomics of an outbreak of the potato late blight pathogen, Phytophthora infestans, reveals both clonality and high genotypic diversity. Mol. Plant Pathol. 2019;20:1134–1146. https://doi.org/10.1111/mpp.12819

Nobuyuki S, Hisashi O, Seishi A, Akiha U et al. An easy direct zoosporangia sampling method for collecting Phytophthora infestans Isolates. J.Res. Fac. Agr. Hokkaido Univ. 2019;74:1–5. http://hdl.handle.net/2115/73697

Saville AC, La Spada F, Faedda R, Migheli Q et al. Population structure of Phytophthora infestans collected on potato and tomato in Italy. Plant Pathol. 2021;70:2165–2178 https://doi.org/10.1111/ppa.13444

Shchetina S, Mostoviak I, Fedorenko V Phytosanitary state of open-field vegetable crop agroecosystems of the genus Solanum, Raphanus, Brassica in the central part of the Right-Bank Forest-Steppe of Ukraine. Quarantine and Plant Protection. 2023;4(275):Р. 32–38. https://doi.org/10.36495/2312-0614.2023.4.32-38

Stroud JA, Shaw DS, Hale MD, Steele KA SSR assessment of Phytophthora infestans populations on tomato and potato in British gardens demonstrates high diversity but no evidence for host specialization. Plant Pathol. 2016;65:334–341. https://doi.org/10.1111/ppa.12407

Tamura K, Stecher G, Kumar S MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11. Molecular Biology and Evolution. 2021;38:3022–3027. https://doi.org/10.1093/molbev/msab120

##submission.downloads##

Опубліковано

2025-12-20

Номер

Розділ

ЕКСПЕРИМЕНТАЛЬНІ ПРАЦІ