RA PD-АНАЛІ З PSEUDOMONAS SYRINGAE, ВИДІЛЕНИХ З БУР ’ЯНІВ В АГРОФІТОЦЕНО ЗІ ПШЕНИЦІ
DOI:
https://doi.org/10.18524/2307-4663.2014.3(27).48287Ключові слова:
Pseudomonas syringae, генетична різноманітність, RАPD‑ПЛР аналізАнотація
Мета роботи. Дослідження генетичної різноманітності штамів Pseudomonas syringae, виділених з різних видів бур’янів: хвощу польового, березки польової, плоскухи звичайної, осоту польового, підмаренника чіпкого, редьки дикої та лободи білої, що мали ознаки бактеріального ураження. Методи. RАPD–ПЛР аналіз. Результати. Проаналізовано штами Pseudomonas syringae, ізольовані з різних видів бур’янів в агрофітоценозі пшениці. Встановлено спорідненість ізольованих нами штамів з неопатотиповим штамом Pseudomonas syringae pv. atrofaciens PDDCC 4394 і типовим штамом Pseudomonas syringae pv. syringae NCPPB 281. Більшість виділених штамів мали високий ступінь спорідненості зі збудником базального бактеріозу пшениці P. syringae pv. atrofaciens, що є найпоширенішим на зернових культурах. Менш поширеним на пшениці є збудник бактеріального опіку P. syringae pv. syringae і лише три штами бактерій, виділених з бур’янів, мали з ним спільні продукти реакції. Висновки. Штами P. syringae, виділені з різних видів бур’янів, і штами Pseudomonas syringae pv. syringae NCPPB 281 та Pseudomonas syringae pv. atrofaciens PDDCC 4394, збудники бактеріальних хвороб пшениці, є генетично однорідною групою. Це підтверджує гіпотезу про те, що бур’яни є однією з екологічних ніш збереження і виживання збудників бактеріозів та за сприятливих умов можуть бути джерелом інфекції.
Посилання
Боброва В.К., Милютина И.А., Троицкий А.В. Генетическое разнообразие псевдомонад, ассоциированных с зерновыми культурами, пораженными базальным бактериозом // Микробиология. – 2005. – Т. 74, № 4. – С. 537–544.
Буценко Л.Н., Пасичник Л.А., Коломиец Ю.В. RAPD-анализ популяции Pseudomonas syringae pv. atrofaciens в Украине // Материалы VII Mежд. конф. “Современное состояние и перспективы развития микробиологии и биотехнологии” (Минск, 31 мая – 4 июня 2010 г.) – Минск, Беларусь, 2010. – С. 12–13.
Гвоздяк Р.И., Яковлева Л.М., Пасичник Л.А., Щербина Т.Н., Огородник Л.Е. Бактерии рода Pseudomonas на сорняках // Мiкробiол. журн. – 2005. 67, № 2. – С. 63–69.
Пасичник Л.А., Патыка В.Ф., Ходос С.Ф., Винничук Т.С. Базальный бактериоз пшеницы и влияние агротехнических приемов на его распространение // Микробиол. журн. – 2012. – 74, № 4. – Р. 37–44.
Пасичник Л.А, Савенко Е.А., Буценко Л.Н., Щербина Т.Н., Патыка В.Ф. Pseudomonas syringae – возбудитель бактериальных болезней сорняков // Мікробіол. журн. – 2013. – т. 75, № 4. – С. 41–46.
Clerc A., Manceau C., Nesme X. Comparison of randomly amplified polymorphic DNA with amplified fragment length polymorphism to assess genetic diversity and genetic relatedness within genospecies III of Pseudomonas syringae // Appl. Environ. Microbiol. – 1998. – Vol. 64, N 4. – P. 1180–1187.
Khoodoo M.H.R., Jaufeerally-Fakim Y. RAPD-PCR fingerprinting and southern analysis of Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae strains isolated from different aroid hosts and locations // Plant Dis. – 2004. – Vol. 88, N 9. – P. 980–988.
Little E. L., Bostock R. M., Kirkpatrick B. C. Genetic Characterization of Pseudomonas syringae pv. syringae Strains from Stone Fruits in California // App. Environ. Microbiol. –1998. – Vol. 64, N 10. – P. 3818–3823.
Louws F.J., Fulbright D.W., Stephens C.T., de Bruijn F.J. Specific genomic fingerprints of phytopathogenic Xanthomonas and Pseudomonas pathovars and strains generated with repetitive sequences and PCR // Appl. Environ. Microbiol. – 1994. – Vol. 60, N 7. – P. 2286–2295.
Louws F.J., Rademaker I.L.W., de Bruijn F.J. The three DS of PCR-based genomic analysis of phytobacteria: diversity, detection and diseases diagnosis // Ann. Rev. Phytopathol. – 1999. – Vol. 37. – P. 81–125.
Montero-Astúa M., Hartung J. S., Aguilar E., Chacón C., Li W., Albertazzi F. J., Rivera C. Genetic diversity of Xylella fastidiosa strains from Costa Rica, São Paulo, Brazil, and United States // Phytopathology. – 2007. – Vol. 97, N 10. – Р. 1338–1347.
Мотоl M.T., Momol E.A., Lamboy W.F., Norelli J.L., Beer S.V., Aldwinekle H.S. Characterization of Erwinia amylovora strains using random amplified polymorphic DNA fragments (RAPDs) // J. Appl. Microbiol. – 1997. – Vol. 82, N 3. – p. 389–398.
Osborn M., Smith C. (eds). Molecular microbial ecology Published/Created: New York, NY: Taylor & Francis, c 2005. ISBN: 1859962831
Sazakli E., Leotsinidis M., Vantarakis A., Papapetropoulou M. Comparative typing of Pseudomonas species isolated from the aquatic environment in Greece by SDS-PAGE and RAPD analysis // J. Appl. Microbiol. – 2005. – Vol. 99. – P. 1191– 1203.
Williams J.G., Kubelik A.R., Livar K.J., Rafalski J.A., Tingey S.V. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucl. Acids. Res. – 1990. – 18, N 22. – P. 6531–6535.
##submission.downloads##
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2014 Мікробіологія і біотехнологія
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
Автор передає журналу (університету) на безоплатній основі невиключні права на використання статті (на весь строк дії авторського права починаючи з моменту публікації, розміщення статті на веб-сторінці журналу, в репозитарії відкритого доступу) без одержання прибутку; на відтворення статті чи її частин в електронній формі (включаючи цифрову); виготовлення ії електронних копій для постійного архівного зберігання; виготовлення електронних копій статті для некомерційного розповсюдження; внесення статті до бази даних репозитарію; надання електронних копій статті в доступі мережі інтернет.
Автор гарантує, що у статті не використовувалися статті або авторські права, які належать третім особам; гарантує, що на момент розміщення статті на веб-сторінці, в репозитарії ОНУ лише йому належать виключні майнові права на статтю, що розміщується; майнові права на статтю ні повністю, ні в частині нікому не передано (не відчуджено), майнові права на статтю ні повністю, ні в частині не є предметом застави, судового спору або претензій з боку третіх осіб.
Автор зберігає за собою право використовувати самостійно чи передавати права на використання статті третім особам.
Автор надає журналу право на використання статті такими способами:
переробляти, адаптувати або іншим чином змінювати її за погодженням з автором; перекладати статтю у випадку, коли стаття викладена мовою іншою, ніж мова, якою передбачена публікація у виданні. Якщо журнал виявить бажання використовувати статтю іншими способами: перекладати, розміщувати повністю або частково у мережі інтернет, публікувати статтю в інших, в тому числі іноземних виданнях, включати статтю як складову частину до інших збірників, антологій, енциклопедій тощо, умови оформлюються додатковою угодою.
Автор підтверджує, що він є автором (співавтором) цієї статті; авторські права на дану статтю не передані іншому видавцю; дана стаття не була раніше опублікована у будь-якому іншому виданні до публікації її журналом.
Публікація праць в Журналі здійснюється на некомерційній основі. Комісійна плата за оформлення статті не стягується.
