ПЛАЗМІДНІ ПРОФІЛІ ФІТОПАТОГЕННИХ БАКТЕРІЙ РОДІВ ERWINIA, RALSTONIA, AGROBACTERIUM, ВИЗНАЧЕНІ РІЗНИМИ МЕТОДАМИ

Автор(и)

  • Ж. Ю. Сергєєва Одеський національний університет імені І.І. Мечникова, Україна
  • В. О. Іваниця Одеський національний університет імені І.І. Мечникова, Україна https://orcid.org/0000-0001-5325-3800

DOI:

https://doi.org/10.18524/2307-4663.2014.4(28).48410

Ключові слова:

Erwinia carotovora, Ralstonia solanacearum, Agrobacterium tumefaciens, фітопатогени, плазміди

Анотація

Метою дослідження було вивчення плазмідних профілів та ефективності виділення плазмід грамнегативних фітопатогенних бактерій різними методами. Методи. Використано штами фітопатогенних бактерій E. carotovora, A. tumefaciens, R. solanacearum. Виділення плазмідних ДНК з клітин бактерій здійснювали лужним методом Кадо і Ліу, модифікованим лужним методом Кадо і Ліу, модифікованим методом Дженсена та методом Кроса. Плазмідну ДНК аналізували за допомогою електрофорезу в агарозному гелі. Результати. Показано, що в середньому від 13% до 30% вивчених штамів фітопатогенних бактерій утримують позахромосомні генетичні елементи. Встановлено, що з клітин бактерій, які виросли на рідкому селективному середовищі (пектин або картопляне середовище), позахромосомні ДНК виділяються набагато ефективніше і бактеріальна хромосома краще елімінується. Висновок. Для виділення плазмідної ДНК з клітин штамів грамнегативних фітопатогенних бактерій E. carotovora, A. tumefaciens, R. solanacearum найбільш універсальним є модифікований для фітопатогенних бактерій лужний метод Кадо і Ліу.

Посилання

Сергеева Ж.Ю. Распространение внехромосомных кольцевых ДНК у Erwinia carotovora / Ж.Ю. Сергеева, Ф.И. Товкач // Доп. НАН України. – 2008. – № 12. – С. 149–153.

Товкач Ф.И. Выделение и предварительная характеристика криптических плазмид Erwinia carotovora / Ф.И. Товкач // Микробиология. – 2001. – Т. 70, № 6. – С. 804–810.

Coplin D.L. Plasmids and their role in the evolution of plant pathogenic bacteria / D.L. Coplin // Ann. Rev. Phytopathol. – 1989. – V. 27. – P. 187–212.

Couturier M. Identification and classification of bacterial plasmids / M. Couturier, F. Bex, P. L. Bergquist [et al.] // Microbiol. Rev. – 1988. – V. 52, № 3. – P. 375–395.

Jensen G.B. The genetic basis of aggregation system in Bacillus thuringiensis subsp. israelensis is located on the large conjugative plasmid pXO16./ G. B.Jensen et al. // J. Bacteriol. – 1995. – V. 177. – Р. 2914–2917.

Kado C.J. Rapid procedure for detection and isolation of large and small plasmids / C. J. Kado, S.-T. Liu // J. Bacteriol. – 1981. – V. 145, № 3. – P. 1365–1373.

Kado C.I. Origin and evolution of plasmids / C.I. Kado // Antonie van Leeuwenhoek. – 1998. – V. 73, № 1. – P. 117–126.

Reyes-Ramırez A. Plasmid Patterns of Bacillus thuringiensis Type Strains. / A. Reyes-Ramırez, J. E. Ibarra // Applied And Environmental Microbiology. – 2008. – V. 74, № 1. – Р. 125–129.

Rohde C. Plasmid isolation from bacteria: some fast procedures/ C. Rohde // World Journal of Microbiology and Biotechnology. – 1995. – V. 11, Issue 3. – P. 367–369.

Vivian A. The roles of plasmids in phytopathogenic bacteria: mobile arsenals? / A. Vivian, J. Murillo, R.W. Jackson // Microbiology. – 2001. – V. 147, № 4. – P. 763–780.

##submission.downloads##

Опубліковано

2015-08-22

Номер

Розділ

ЕКСПЕРИМЕНТАЛЬНІ ПРАЦІ