ХАРАКТЕРИСТИКА ПУРПУРОВИХ НЕСIРКОВИХ БАКТЕРIЙ RHODOPSEUDOMONAS PALUSTRIS З ОЗЕРА ЯВОРIВСЬКЕ (УКРАЇНА )
DOI:
https://doi.org/10.18524/2307-4663.2013.4(24).48980Ключові слова:
пурпурові несіркові бактерії, Rhodopseudomonas palustrisАнотація
Мета роботи. Виділення з води озера Яворівське, ідентифікація та дослідження пурпурових несіркових бактерій, які можуть утилізувати сірководень і добре рости завдяки використанню органічних сполук. Методи. Бактерії культивували анаеробно чи у мікроаерофільних умовах на світлі та у темряві на середовищах Ван Ніля і PNSB за внесення різних донорів електронів, джерел карбону і нітрогену. Біомасу визначали за мутністю розведеної суспензії клітин фотометруванням на КФК-3. Концентрацію S2- визначали турбідиметрично за утворенням метиленової сині. Сірку екстрагували з культурального середовища фільтруванням через нітроцелюлозні фільтри, надалі її концентрацію визначали за методом Ван Гемердена. Аналіз пігментного складу здійснювали спектрофотометрично на Spеcord M-40. Ультраструктуру клітин бактерій досліджували за допомогою трансмісійного електронного мікроскопа ПЕМ-100. Зразки генів 16S ДНК ампліфікували методом ПЛР. Первинну структуру фрагментів визначали на GATC Biotech AG (Konstanz, Germany). Результати. Отримали чисті культури пурпурових несіркових бактерій. Клітини дослідженого штаму паличкоподібні, рухливі. Фотосинтетичні мембрани ламелярного типу, основні пігменти – бактеріохлорофіл а та каротиноїди спірилоксантинової серії. Бактерії ростуть як хемотрофно, так і фототрофно, при використанні сірководню як донора електронів утворюють сірку, що виводиться у культуральне середовище. Використовують різні донори електронів, джерела карбону та нітрогену. Є факультативними анаеробами. Генетично близькі до видів Rhodopseudomonas faecalis (99%) і Rhodopseudomonas palustris (98%), Rhodopseudomonas rhenobacensis (98%). Висновок. Виділені з води озера Яворівське пурпурові несіркові бактерії ідентифіковані нами за морфо-фізіологічними ознаками і за результатами аналізу нуклеотидної послідовності гену 16S рРНК як Rhodopseudomonas palustris. Вони можуть утилізувати сірководень і добре рости завдяки використанню органічних сполук.
Посилання
Мороз О.М., Колісник Я.I., Подопригора О.I., Клим I.Р., Гудзь С.П., Борсукевич Б.М., Гнатуш С.О. Мікрофлора води озера Яворівське // Науковий вісник Ужгородського ун-ту. Серія біологія. – 2008. – 24. – С. 131–138. 2. Мусієнко М.М., Паршикова Т.В., Славний П.С. Спектрофотометричні методи в практиці фізіології, біохімії та екології рослин. Київ: Фітосоціоцентр, 2001. – 200 с. 3. Родина А. Г. Методы водной микробиологии. Практ. руководство. – М.–Л.: Наука, 1965. – 363 с. 4. Akiba T., Usami R., Horikoshi K. Rhodopseudomonas rutila, a new species of non-sulfur purple photosynthetic bacteria // International Journal of Systematic Bacteriology. – 1983. – 33, № 3. – Р. 551–556. 5. Barns S.M., Pelletier D.A, Lane D.J., Weisburg W.G. 16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study // J. Bacteriol. – 1991. – 173, № 2. – Р. 697–703. 6. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. – 10th ed. – New York, 2005. – Vol. 2. – 1416 p. 7. Britton G. General carotenoid methods // Meth. Enzymol. – 1985. – 3. – Р. 113–145. 8. Gemerden H. Growth measurements of Chromatium cultures // Arhiv. Mikrobiol. – 1968. – 64. – Р. 103–110. 9. Hirashi A., Santos T., Siguyama J., Komagata K. Rhodopseudomonas rutila is a later subjective synonym of Rhodopseudomonas palustris // International Journal of Systematic Bacteriology. – 1992. – 42, № 1. – 186–188. 10. Imhoff J. Caumette P. Recommended standards for description of new species of anoxygenic phototrophic bacteria // J. Syst. Bacteriol. – 2004. – 54. – Р. 1415–1421. 11. Reynolds E.S. The use of lead citrate at pH as an electronopaque stain in electron microscopy // J. Cell Biol. – 1963. – 17. – Р. 208–212. 12. Visser J., Robertson L., Verseveld H., Kvuenen G. Sulfur production by obligately chemolithoautotrophic Thiobacillus species // Applied and Environmental Microbiology. – 1997. – 63, № 6. – Р. 2300–2305. 13. Yongqin J., Kappler A., Croal L., Newman D. Isolation and characterization of a genetically tractable photoautotrophic Fe(II)-oxidizing bacterium, Rhodopseudomonas palustris strain TIE-1 // Applied and Еnvironmental Microbiology. – 2005. – 71, № 8. – Р. 4487–4496. 14. Zhang D., Yang H., Huang Z., Zhang W., Liu S. J. Rhodopseudomonas faecalis sp. nov., a phototrophic bacterium isolated from an anaerobic reactor that digests chicken faeces // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. – 2002. – 52. – Р. 2055–2060. 15. Пат.6340596 США, МКИ G 01 N33 /00. Reagent composition for measuring hydrogen sulfide and method for measuring hydrogen / Masami Sugiyama (Японія); Fujirebio Inc. № 248316; Заявл. 02.01. 1999. – Опубл. 22.01.2002; НКИ 436.121.
##submission.downloads##
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2013 Мікробіологія і біотехнологія
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
Автор передає журналу (університету) на безоплатній основі невиключні права на використання статті (на весь строк дії авторського права починаючи з моменту публікації, розміщення статті на веб-сторінці журналу, в репозитарії відкритого доступу) без одержання прибутку; на відтворення статті чи її частин в електронній формі (включаючи цифрову); виготовлення ії електронних копій для постійного архівного зберігання; виготовлення електронних копій статті для некомерційного розповсюдження; внесення статті до бази даних репозитарію; надання електронних копій статті в доступі мережі інтернет.
Автор гарантує, що у статті не використовувалися статті або авторські права, які належать третім особам; гарантує, що на момент розміщення статті на веб-сторінці, в репозитарії ОНУ лише йому належать виключні майнові права на статтю, що розміщується; майнові права на статтю ні повністю, ні в частині нікому не передано (не відчуджено), майнові права на статтю ні повністю, ні в частині не є предметом застави, судового спору або претензій з боку третіх осіб.
Автор зберігає за собою право використовувати самостійно чи передавати права на використання статті третім особам.
Автор надає журналу право на використання статті такими способами:
переробляти, адаптувати або іншим чином змінювати її за погодженням з автором; перекладати статтю у випадку, коли стаття викладена мовою іншою, ніж мова, якою передбачена публікація у виданні. Якщо журнал виявить бажання використовувати статтю іншими способами: перекладати, розміщувати повністю або частково у мережі інтернет, публікувати статтю в інших, в тому числі іноземних виданнях, включати статтю як складову частину до інших збірників, антологій, енциклопедій тощо, умови оформлюються додатковою угодою.
Автор підтверджує, що він є автором (співавтором) цієї статті; авторські права на дану статтю не передані іншому видавцю; дана стаття не була раніше опублікована у будь-якому іншому виданні до публікації її журналом.
Публікація праць в Журналі здійснюється на некомерційній основі. Комісійна плата за оформлення статті не стягується.